小便痛、射精痛、尿黄可能由多种原因引起，以下是几种可能的病因：

　　泌尿系统感染：细菌侵入泌尿系统导致炎症，常见的有尿道炎、膀胱炎。会出现尿频、尿急、尿痛等症状。

　　前列腺炎：前列腺发生炎症时，腺体会充血、肿大。射精过程中前列腺会收缩，射精后前列腺处于充血未消退状态，排尿时尿液经过前列腺部尿道，刺激前列腺引起疼痛。患者可能有尿频、尿急、尿不尽等症状。

　　精囊炎：精囊炎常与前列腺炎同时发生，多由于逆行感染所致。炎症状态下，射精后的精囊处于充血、敏感状态，排尿时尿液刺激精囊腺及后尿道，就会引起疼痛。患者可能伴有血精、下腹部疼痛等症状。

　　尿路结石：结石刺激尿路黏膜，引起疼痛，还可能影响尿液排出，导致尿液浓缩变黄。

　　性生活不节制：性生活过于频繁、过度手淫等情况，容易导致生殖器官反复充血，射精后局部肌肉疲劳、敏感性增加。排尿时，尿液的冲刷刺激就容易引起疼痛。

　　出现这些症状应引起重视，及时到正规医院就诊，进行相关检查，如尿常规、白带常规等，明确病因后在医生的指导下进行治疗。同时要注意个人卫生，多喝水，避免食用辛辣刺激性食物。